Array- CGH (Comparative Genome Hybridization)
τεχνική συγκριτικού γενωμικού υβριδισμού
τεχνική που επιτρέπει ταυτόχρονα ανίχνευση ελλείψεων ή διπλασιασμών σε ολόκληρο το γονιδίωμα. Συνοπτικά η τεχνική περιλαμβάνει :
1. πέψη του DNA με ειδικά περιοριστικά ένζυμα,
2. σήμανση των κομμένων προϊόντων με φθορίζουσες χρωστικές.
3. τα σημασμένα προϊόντα υβριδίζονται πάνω σε μικροσυστοιχία (microarray) στην οποία έχουν σταθεροποιηθεί ολιγονουκλεοτίδια που αντιπροσωπεύουν ολιγομερή βάσεων στο γονιδίωμα που μελετάται.
4. η υβριδοποίηση ακολουθείται από από άμεσο σκανάρισμα των πλακιδίων με χρήση λογισμικού και τα αποτελέσματα συγκρίνονται με αντίστοιχα από υπάρχουσες βάσεις δεδομένων στο διαδίκτυο ενώ η διαδιακασία γίνεται παράλληλα και σε δείγμα DNA φυσιολογικού ατόμου ή ατόμου αναφοράς.
Με το κατάλληλο λογισμικό το σκανάρισμα γίνεται κατά μήκος του ιδεογράμματος κάθε χρωμοσώματος δίνοντας τη μορφή μοριακού καρυοτύπου με δυνατότητα ελέγχου μικρότερων περιοχών από ότι στο συμβατικό καρυότυπο. Η τεχνική πάντα δείχνει διαφοροποιήσεις από το δείγμα ελέγχου καθώς εντοπίζει και πολυμορφικές διαφορές στην αλληλουχία DNA που δεν είναι απαραίτητα παθολογικές (πχ CNVs πολυμορφισμοί)
τεχνική συγκριτικού γενωμικού υβριδισμού
τεχνική που επιτρέπει ταυτόχρονα ανίχνευση ελλείψεων ή διπλασιασμών σε ολόκληρο το γονιδίωμα. Συνοπτικά η τεχνική περιλαμβάνει :
1. πέψη του DNA με ειδικά περιοριστικά ένζυμα,
2. σήμανση των κομμένων προϊόντων με φθορίζουσες χρωστικές.
3. τα σημασμένα προϊόντα υβριδίζονται πάνω σε μικροσυστοιχία (microarray) στην οποία έχουν σταθεροποιηθεί ολιγονουκλεοτίδια που αντιπροσωπεύουν ολιγομερή βάσεων στο γονιδίωμα που μελετάται.
4. η υβριδοποίηση ακολουθείται από από άμεσο σκανάρισμα των πλακιδίων με χρήση λογισμικού και τα αποτελέσματα συγκρίνονται με αντίστοιχα από υπάρχουσες βάσεις δεδομένων στο διαδίκτυο ενώ η διαδιακασία γίνεται παράλληλα και σε δείγμα DNA φυσιολογικού ατόμου ή ατόμου αναφοράς.
Με το κατάλληλο λογισμικό το σκανάρισμα γίνεται κατά μήκος του ιδεογράμματος κάθε χρωμοσώματος δίνοντας τη μορφή μοριακού καρυοτύπου με δυνατότητα ελέγχου μικρότερων περιοχών από ότι στο συμβατικό καρυότυπο. Η τεχνική πάντα δείχνει διαφοροποιήσεις από το δείγμα ελέγχου καθώς εντοπίζει και πολυμορφικές διαφορές στην αλληλουχία DNA που δεν είναι απαραίτητα παθολογικές (πχ CNVs πολυμορφισμοί)
Δεν υπάρχουν σχόλια:
Δημοσίευση σχολίου